Биоинформатика. Учебник

Список сокращений
Введение
Глава 1. Классификация баз данных в
биоинформатике
Глава 2. NCBI
2.1. Наиболее популярные ресурсы NCBI
2.2. Руководство к NCBI и система Entrez
2.3. Работа с NCBI
Глава 3. EMBL-EBI
3.1. Характеристика EMBL-EBI
3.2. Работа с EMBL-EB1
Глава 4. Геномный браузер ENSEMBL
4.1. Характеристика Ensembl
4.2. Аннотация генов Ensembl
4.3. Геномный браузер Ensembl
4.4. Работа с геномным браузером Ensembl
Глава 5. Геномный браузер UCSC
5.1. Характеристика UCSC
5.2. Работа с UCSC
Глава 6. Парное выравнивание
последовательностей
6.1. Выполнение глобального и локального парного
выравнивания
Глава 7. BLAST
7.1. Характеристика BLAST
7.2. Работа с BLAST
Глава 8. Множественное выравнивание
последовательностей
8.1. Определение, этапы и методы множественного
выравнивания
8.2. Выполнение множественного выравнивания
Глава 9. Молекулярная эволюция, филогения
9.1. Определение и гипотезы молекулярной
эволюции
9.2. Филогенетический анализ
9.3. Работа с MEGA
Глава 10. Анализ экспрессии генов (микрочипы)
10.1. Анализ экспрессии генов с помощью
микрочипов
10.2. Работа с данными экспериментов Microarray в
GEO и GE02R
Глава 11. Анализ биологических путей
11.1. Базы данных биологических путей
11.2. Работа с базами данных биологических путей
Глава 12. Изучение структуры и функций белков
12.1. Методы изучения свойств белков
12.2. PDB
12.3. UniProt
12.4. Работа с инструментами для изучения свойств
белков
Глава 13. Молекулярный докинг
13.1. Определение, оценочные функции,
программы для молекулярного докинга
13.2. Молекулярное моделирование
взаимодействий белка и лиганда с помощью
AutoDockTools
Глава 14. Предсказание структуры и функций
белков
14.1. Методы предсказания свойств белков
14.2. Функциональный анализ и определение
структуры алкалинпротеазы
Глава 15. Анализ метаболизма химических
соединений
Глава 16. Биотехнические системы и
биоинформационные ресурсы
Заключение
Рекомендуемые литература и интернет-ресурсы